เคนชินผู้เคยเป็น “มือพิฆาตบัตโตไซ” ในยุคสงคราม เมื่อเข้าสู่ยุคใหม่ เขาสาบานตนว่าจะไม่ฆ่าใครอีก และใช้ชีวิตเป็นคนพเนจร ต่อมาเมื่อ โอคุโบะ โทชิมิจิ ผู้นำรัฐบาลถูกสังหาร และผู้ที่อยู่เบื้องหลังก็คือ ชิชิโอ มาโคโตะ ที่วางแผนโค่นล้มรัฐบาลเมจิ เคนชินจึงลาจากพวกพ้อง และมุ่งหน้าไปเกียวโตเพื่อหยุดยั้งแผนการของชิชิโอ การต่อสู้ครั้งใหม่ที่เปี่ยมไปด้วยนึกคิดมากมายของซามูไรพเนจร บัดนี้กำลังจะเริ่มขึ้นแล้ว