แม้จะฉายต่อจาก The Last Naruto The Movie แต่ในด้านเนื้อเรื่องของ Boruto Naruto the Movie นั้นจะดำเนินเรื่องต่อจาก มินิซีรีย์ Naruto Gaiden: The Seventh Hokage โดยเน้นในเรื่องราวความสัมพันธ์ของรุ่นลูกกับบรรดาพ่อๆ ของพวกเขา ทั้งทางด้านของ “โบรูโตะ” ลูกชายตัวแสบของนารูโตะ และ “ซาราดะ” ลูกสาวผู้สืบทอดพลังแห่งตระกูลอุจิวะของซาสุเกะ เมื่อนารูโตะสามารถก้าวขึ้นเป็นโฮคาเงะรุ่นที่ 7 ต่อจาก “ฮาตาเกะ คาคาชิ” ผู้เป็นอาจารย์ในรุ่นที่ 6 ได้สำเร็จ ทำให้ต้องแบกรับกับภาระหน้าที่ต่างๆ จนไม่สามารถมีเวลาให้กับครอบครัวของตัวเอง จนกลายเป็นชนวนทำให้เกิดเรื่องราวใหญ่โตขึ้นในภาคนี้